Im Jahr 2024 führte n6 icon96™ ein und definierte damit die Erwartungen an die PCR-Amplifikation bei der Vorbereitung von NGS-Bibliotheken neu. Durch die Überwachung jedes Wells in Echtzeit und das Stoppen der Amplifikation, sobald eine Probe ihren optimalen Endpunkt erreicht, eliminiert die AutoNorm™-Technologie das Rätselraten, die manuelle Quantifizierung und die kaskadierende Variabilität, die lange Zeit zu Engpässen bei genomischen Arbeitsabläufen geführt haben.

Heute wird die icon96-Plattform in führenden Genomikkernen und Forschungseinrichtungen in mehr als 22 Ländern eingesetzt, darunter dem Broad Institute und dem Wellcome Sanger Institute. Die Plattform unterstützt ein wachsendes Spektrum an Sequenzierungsabläufen in der Genomforschung, bei klinischen Anwendungen und neuen Sequenzierungsmodalitäten.

AutoNorm wird zunehmend in Arbeitsabläufen wie der cfDNA-Sequenzierung, der Erkennung minimaler Resterkrankungen, der Einzelzell-RNA-Sequenzierung und der räumlichen Transkriptomik eingesetzt, bei denen sich Amplifikationsverzerrungen erheblich auf nachgelagerte Ergebnisse auswirken können. Die Plattform ist sequenzer- und anwendungsunabhängig und lässt sich in bestehende Bibliotheksvorbereitungs-Workflows und wichtige NGS-Plattformen integrieren.

Aufbauend auf dieser Dynamik bringt n6 mit der Einführung von icon16™ den gleichen Standard der adaptiven Verstärkung in mehr Labore.

icon16 ist kein abgespecktes Instrument. Es handelt sich um AutoNorm im 16-Well-Format, das speziell für Labore entwickelt wurde, die NGS mit geringerem Durchsatz betreiben, einschließlich Einzelzell-RNA-Sequenzierung, räumlicher Transkriptomik, cfDNA- und MRD-Assays, Sequenzierung seltener Krankheiten und anderen Arbeitsabläufen, bei denen Forscher normalerweise kleinere Probenmengen verarbeiten.

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In vielen Arbeitsabläufen mit geringem Aufwand wie Einzelzell- oder räumlicher Transkriptomik bedeutet eine fehlerhafte Bibliothek, dass eine Probe nicht wiederhergestellt werden kann. In diesen Situationen ist Qualität keine Bequemlichkeit, sondern der Unterschied zwischen einem Ergebnis und einem Verlust. Während ein 96-Well-Gerät die Durchsatzanforderungen vieler Labore übertreffen kann, gilt dies nicht für die Anforderungen an eine zuverlässige Datenqualität. In der Vergangenheit war der Symbolstandard für diese Benutzer unerreichbar. icon16 ändert das.

Die Sequenzierungstechnologie hat sich rasant weiterentwickelt, aber der Thermocycler im Zentrum der Bibliotheksvorbereitung hat sich in den letzten Jahrzehnten kaum verändertMit icon96 haben wir AutoNorm eingeführt, um den einheitlichen Ansatz zur Verstärkung zu ersetzen. icon16 bietet Laboren, die kleinere Sequenzierungschargen durchführen, dieselben Möglichkeiten und behält dabei den gleichen Standard an Datenqualität bei.“

Pranav Patel, PhD, MBA, Mitbegründer und CEO, n6

AutoNorm ersetzt die PCR mit festem Zyklus durch Echtzeit-Fluoreszenzüberwachung auf der Ebene einzelner Wells. Anstatt jede Probe mit der gleichen vorgegebenen Anzahl von Zyklen zu durchlaufen, stoppt das System jede Vertiefung unabhängig, sobald sie einen benutzerdefinierten Verstärkungsschwellenwert erreicht. Das Ergebnis ist eine Platte mit Bibliotheken, die durch die Biologie – nicht durch das Protokoll – normalisiert sind, ohne übermäßige Zyklusartefakte, ohne Aussetzer und ohne manuelle Quantifizierung oder Bereinigung vor dem Pooling.

„Es gibt nicht viele Technologien, die etablierte Arbeitsabläufe von Anfang an erheblich beeinflussen können“, sagte James Docker, NGS-Leiter und Multi-Omics-Wissenschaftler am Centre for Human Genetics der Universität Oxford. „Aber mit der AutoNorm-Technologie sind wir in der Lage, die Herangehensweise an die PCR bei der Bibliotheksvorbereitung grundlegend zu ändern.“

Das icon16 ist reagenzunabhängig, mit den wichtigsten kommerziellen Bibliotheksvorbereitungskits kompatibel und erfordert keine Änderungen an bestehenden NGS-Workflows. Das System wird ab dem 30. März 2026 zum Kauf verfügbar sein, die ersten Lieferungen werden kurz danach erwartet. Der Start fällt mit der ABRF 2026 zusammen, die vom 28. bis 31. März stattfindet.

Quellen:

n6